微生物组计划自年在欧美大陆兴起，经过十年的高速发展业已在全球范围内蔓延。近两年，全球关于微生物组的研究氛围像极了今年夏天，火热且持久。几乎每年第一季度，Cell、Nature和Science三家顶级期刊都会以特刊形式刊发一期与微生物组研究相关的成果；各国科学家关于微生物组的研究文章也频频登上CNS杂志封面。

近几年，国人科学家在该研究领域成果斐然，基础研究、农业生产和临床转化方向均有突破，诸如：

拟南芥特异代谢网络选择性调控根系微生物组

（Science,）

肠道菌群-胆汁酸-IL22轴调控多囊卵巢综合征

（NatureMedicine,）

类似的消息经常刷爆朋友圈，很心动有没有，然而你还再为科研选题而烦恼？实验进度超期而抓狂？毕业需要文章而惆怅？

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一、研究思路

以小欧服务客户发表文章为例，我们来看看那些小而美微生物组研究相关SCI文章的常规设计思路。

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案例一：甘草酸调节肠道菌群防止高脂饮食增强的转移前生态位形成和转移

期刊：MucosalImmunology

IF：7.

样本来源：小鼠粪便

样本个数：12个

DOI:10./s---6

技术路线

研究结果

研究证明甘草酸（GA）可以通过肠道微生物群降低高脂饮食（HFD）增强的转移前微环境的形成和转移。GA降低了4T1乳腺癌和B16F10黑色素瘤中HFD增强的骨髓源性抑制细胞募集、转移前蛋白SA8/A9表达和转移负担，并伴有肠道菌群改变和结肠巨噬细胞远离M1样表型的极化。机制层面上，GA处理通过减少M1样巨噬细胞的比例以及由LPS/HMGB1/NF-κB信号失活引发的CCL2、TNF-α的表达下调，抑制了Gr-1+骨髓细胞迁移和SA8/A9表达，进而中和了HFD促进的肠道微生物群失调的作用。综上所述，GA靶向肠道菌群调控结肠巨噬细胞可作为一种防止HFD促进转移前微环境形成和转移的新策略。

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案例二：入侵植物紫茎泽兰根系对土壤中稀有细菌的富集作用

期刊：ScienceoftheTotalEnvironment

IF：5.

样本来源：土壤

样本个数：27个

DOI:10./j.scitotenv..05.

技术路线

研究结果

比较不同分组样本（根系与根际土壤）的测序结果，表明根系细菌与根际土壤细菌差异显著。在门水平上，厚壁菌门（Firmicutes）在根系（45.68%）和根际土壤（29.78%）中均有分布，且根系中的变形菌门（Proteobacteria）含量（46.59%）显著高于根际土壤（24.76%），拟杆菌门（Bacteroidetes）在根际土壤中含量较高（39.06%）。在纲水平上，梭状芽孢杆菌纲（Clostridia）在根系（44.98%）与根际土壤（27.47%）中均存在，拟杆菌纲（Bacteroidia）在根际土壤中含量较高（35.56%），丙型变形菌纲（Gammaproteobacteria）在根系中含量较高（27.51%）。在属水平上，梭状杆菌属（Clostridium）和肠杆菌属（Enterobacter）在根系中的含量显著高于根际土壤。因此，根系中的微生物可能是从根际土壤中富集的。本研究表明，入侵植物紫茎泽兰根系可从根际土壤中选择性富集梭状芽胞杆菌（Clostridium）和肠杆菌（Enterobacter），改变植物根系和根际土壤微生物的群落结构。其中肠杆菌可促进入侵植物生长，抑制本地植物生长。

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案例三：零价铁活化过硫酸盐修复多环芳烃污染土壤

期刊：ChemicalEngineeringJournal

IF：8.

样本来源：土壤

样本个数：19个

DOI:10./j.cej..08.

技术路线

研究结果

研究证明纳米级尺寸的零价铁（nZVI）为水体和土壤中活化过硫酸盐离子（PS）的最有效的物质，nZVI/PS对于低分子量的多环芳烃（PAHs）的去除效率高于高分子量多环芳烃，在天时，表层土中几乎检测不到PS。在初始的污染土壤中，OTU数量约个（远低于正常土壤的-个的水平），并伴随着修复进程迅速下降到个以下直至修复进程结束。不同ZVI/PS体系对于细菌群落结构的影响是相似，Bacillus和Lactococcus是丰度最高的两个属，与PHAs的降解可能存在着一定的关系。本研究为PS活化修复PAHs污染的土壤和地下水提供了切实的案例，在传统化学方法处理土壤污染的基础上，结合生境中微生物的群落和种类变化，全面和立体的展示了土壤修复过程中土壤本身的变化以及生态环境所受的影响，为将来化学降解和生物降解相结合提供了前瞻性的报道和研究。

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学术公开课通知

主题：微生物多样性技术介绍

时间：9月19日

讲座简介：

1、微生物多样性技术简介

2、微生物分析内容简介

3、文章案例及思路介绍

欢迎扫描文末







































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